下脂肪和肌内脂肪（IMF）沉积与肉类产量和猪肉品质密切相关。定源猪作为我国土猪品种，选择率低导致种群遗传和表型差异明显。人群中脂肪含量极高的个体是研究脂肪沉积机制的理想模型。在这项研究中，我们使用RNA-Seq和串联质量标签（TMT）蛋白质组学来分析定远猪特异性调节皮下脂肪和IMF沉积的关键途径和基因。我们在高背脂肪厚度（HBF，LBF）组中鉴定了191个差异表达基因（DEGs）和61个差异丰度蛋白（DAP），在高肌内脂肪（HIMF，LIMF）组中获得了85个DEGs和12个DAP。功能分析表明，背膘组的DEGs和DAPs主要参与碳水化合物、氨基酸和脂肪酸的代谢，而IMF组参与胰岛素途径、寿命和一些疾病相关途径。我们发现了40个候选基因，这些基因可能使皮下和肌肉注射脂肪的组织特异性脂质沉积。本研究为我国地方猪种脂肪沉积性状的改良提供了理论参考资料

相关研究成果发表在2022.2的Scientific Reports上。研究的蛋白组实验和分析部分，由北京邦菲生物科技有限公司协助完成。

文章参见：Identification of candidate genes that specifically regulate subcutaneous and intramuscular fat deposition using transcriptomic and proteomic profiles in Dingyuan pigs

https://www.nature.com/articles/s41598-022-06868-3