服务简介

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),指由于单个核苷酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,即SNP,它包括单碱基的转换,颠换、插入及缺失等形式。Sequenom MassArray® SNP方法属高通量的SNP分型服务,通过质谱的方法对物质的分子量(质荷比)进行检测,达到区分、鉴别物质的目的。适用于10-200个候选SNP位点的检测。

服务内容

利用Sequenom MassArray对单核苷酸多态性进行检测分析。

原理

Sequenom MassArray® SNP检测过程,结合多重PCR技术、MassArray iPLEX单碱基延伸技术、基质辅助激光解吸/电离-飞行时间、质谱分析技术等,先通过PCR扩增出目标序列,之后加入SNP序列特异延伸引物,在SNP位点上,延伸一个碱基。根据SNP位点的不同,探针将结合不同的ddNTP,进而具有不同的分子量。

应用领域

癌症研究、遗传学分析、分子诊断和药学等领域

技术优势

1.定制灵活:可自由选择SNP位点,自由选择放到一张芯片上。

2.分析准确:直接检测待测样本分子量,准确度高达99%以上。

3.高通量检测:通过一张芯片同时检测384个样本的SNP位点;每个反应孔最高可实现多达40重反应。

实验路线

snp-process

实验仪器

Sequenom MassARRAY

massarray

送样要求

样品类型送样要求
细胞样本细胞样本保证细胞个数在1×10^6~1×10^7质检。干冰运输。
组织样本质量大于30mg;单个组织块质量不大于30mg;组织采集后用液氮速冻。干冰运输。
DNA样本浓度大约25ng/μl,体积大约10μl,吸光度260/280比值1.7-2.0之间,琼脂糖电泳须有大于10kb的明亮单一条带,无RNA及蛋白污染。干冰运输。
血液样本体积大于0.5ml。建议采用EDTA抗凝剂,避免使用肝素抗凝。干冰运输。

结果报告展示

2297550

参考文献

[1] Petrek M.Kishore A, Zizkova V, Genetic association study for idiopathic pulmonary fibrosis in a Czech population: results from a pilot study using Massarray technology. American Journal of respiratory and critical care medicine, 2015,191.

[2] Greenop K R, Scott R J, Attia J, et al. Folate Pathway Gene Polymorphisms and Risk of Childhood Brain Tumors: Results from an Australian Case–Control Study. Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention, 2015, 24(6): 931-937.

[3] Chen W, Wang M, Zhang Z, et al. Replication the association of 2q32.2 – q32.3 and 14q32. 11 with hepatocellular carcinoma. Gene, 2015, 561(1): 63-67.

[]
1 Step 1
在线留言
姓名:
单位:
手机号:
地址:
您的留言:
0 /
Previous
Next
+ 服务说明

服务简介

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),指由于单个核苷酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,即SNP,它包括单碱基的转换,颠换、插入及缺失等形式。Sequenom MassArray® SNP方法属高通量的SNP分型服务,通过质谱的方法对物质的分子量(质荷比)进行检测,达到区分、鉴别物质的目的。适用于10-200个候选SNP位点的检测。

服务内容

利用Sequenom MassArray对单核苷酸多态性进行检测分析。

原理

Sequenom MassArray® SNP检测过程,结合多重PCR技术、MassArray iPLEX单碱基延伸技术、基质辅助激光解吸/电离-飞行时间、质谱分析技术等,先通过PCR扩增出目标序列,之后加入SNP序列特异延伸引物,在SNP位点上,延伸一个碱基。根据SNP位点的不同,探针将结合不同的ddNTP,进而具有不同的分子量。

应用领域

癌症研究、遗传学分析、分子诊断和药学等领域

技术优势

1.定制灵活:可自由选择SNP位点,自由选择放到一张芯片上。

2.分析准确:直接检测待测样本分子量,准确度高达99%以上。

3.高通量检测:通过一张芯片同时检测384个样本的SNP位点;每个反应孔最高可实现多达40重反应。

+ 技术参数

实验路线

snp-process

实验仪器

Sequenom MassARRAY

massarray

送样要求

样品类型送样要求
细胞样本细胞样本保证细胞个数在1×10^6~1×10^7质检。干冰运输。
组织样本质量大于30mg;单个组织块质量不大于30mg;组织采集后用液氮速冻。干冰运输。
DNA样本浓度大约25ng/μl,体积大约10μl,吸光度260/280比值1.7-2.0之间,琼脂糖电泳须有大于10kb的明亮单一条带,无RNA及蛋白污染。干冰运输。
血液样本体积大于0.5ml。建议采用EDTA抗凝剂,避免使用肝素抗凝。干冰运输。

结果报告展示

2297550
+ 文献及案例

参考文献

[1] Petrek M.Kishore A, Zizkova V, Genetic association study for idiopathic pulmonary fibrosis in a Czech population: results from a pilot study using Massarray technology. American Journal of respiratory and critical care medicine, 2015,191.

[2] Greenop K R, Scott R J, Attia J, et al. Folate Pathway Gene Polymorphisms and Risk of Childhood Brain Tumors: Results from an Australian Case–Control Study. Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention, 2015, 24(6): 931-937.

[3] Chen W, Wang M, Zhang Z, et al. Replication the association of 2q32.2 – q32.3 and 14q32. 11 with hepatocellular carcinoma. Gene, 2015, 561(1): 63-67.

+ 联系我们
[]
1 Step 1
在线留言
姓名:
单位:
手机号:
地址:
您的留言:
0 /
Previous
Next