PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,而我们用它来进行蛋白定量。

        通过选择目标蛋白质的定量代表性肽段,让质谱仅对这些肽段进行质谱信号采集,从而获取目标蛋白质定量信息。利用该技术既可实现样品中靶标物质的相对定量,又可通过合成同位素标准肽段,绘制标准曲线,实现蛋白质的绝对定量。

PRM ??

 

 

Poor Rich Money? 

 

        果然过完年想到的都是与钱相关的,那您今年收(fa)了多少压岁钱呢,有没有上(mo)交(shou)呢?

        今天的PRM与这些都没有关系,PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,而我们用它来进行蛋白定量。

        通过选择目标蛋白质的定量代表性肽段,让质谱仅对这些肽段进行质谱信号采集,从而获取目标蛋白质定量信息。利用该技术既可实现样品中靶标物质的相对定量,又可通过合成同位素标准肽段,绘制标准曲线,实现蛋白质的绝对定量。

        大概流程(见下图)就是根据目标蛋白列表结合质谱监测结果得到实际目标蛋白列表,在此过程中需要质谱监测到目标蛋白的特征肽段(unipeptide),且该特征肽段峰图不受其他肽段干扰,因此并不是所有的蛋白都能做成功哦。    

        然后在根据实际目标蛋白列表(可以是很多个)对要检测的样品分别进行检测,最终得到目标蛋白的定量信息。

        PRM最终结果类似于WesternBlot实验后测得的灰度值,却不需要繁琐的实验步骤和繁琐的一抗、二抗。

 

RM相对定量呈现结果。

    还是不够清楚,让我们来举个栗子。

iTRAQ-based proteomic analysis reveals key proteins affecting muscle growth and lipid deposition in pigs

         在该文章中利用iTRAQ蛋白组组学的方法,比较了2种本土猪种(TP和DSP)和2种引进猪种(YY和LL)的蛋白组差异,从中发现影响猪肌肉生长和脂肪沉积的蛋白质。并利用PRM靶向蛋白组的方法,对蛋白差异进行了确证。

PRM 实验部分结果

你知道PRM是什么意思吗??

2019-05-21
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