服务简介

蛋白质组学是以一个细胞、组织内表达的全部蛋白质为研究对象,其具有蛋白质种类复杂多样、丰度范围宽泛等特点。为获得深度覆盖蛋白质表达谱,利用分级方法,根据肽段理化性质的不同将其进行分级操作,降低肽段的复杂程度,提高其鉴定能力。

原理

提取样品中的总蛋白,经胰蛋白酶酶解成肽段后,根据肽段理化性质的不同将其进行分级操作,分级后的肽段利用液相色谱-串联质谱联用进行鉴定,然后进行数据库搜索。

应用领域

蛋白质组全谱分析 疾病标志物研究 品种改良 作物抗逆、发育研究 作用机制研究

技术优势

1.操作简便、快速;

2.通量高,不受样本数量限制;

3.样品需求量低,满足微量样品及临床样本的检测;

4.检测动态范围可以达到106数量级。

实验路线

deep-proteome-coverage-process

实验仪器

Q-Exactive HF, Orbitrap Fusion

送样要求

样品类型送样要求
组织样品动物组织≥15mg;植物组织≥50mg;微生物组织≥20mg
细胞样品细胞量≥107
蛋白溶液≥1ug/μL,蛋白总量≥60μg

参考文献

[1] Rappsilber J, Mann M, Ishihama Y. Protocol for micro-purification, enrichment, pre-fractionation and storage of peptides for proteomics using StageTips. Nature protocols, 2007, 2(8): 1896-1906.

[2] Kulak N A, Pichler G, Paron I, et al. Minimal, encapsulated proteomic-sample processing applied to copy-number estimation in eukaryotic cells. Nat. Methods, 2014, 11(3): 319-324.

[3] Han D, Moon S, Kim Y, et al. In‐depth proteomic analysis of mouse microglia using a combination of FASP and StageTip‐based, high pH, reversed‐phase fractionation. Proteomics, 2013, 13(20): 2984-2988.

[4] Kitata R B, Dimayacyac-Esleta B R T, Choong W K, et al. Mining missing membrane proteins by high-pH reverse-phase StageTip fractionation and multiple reaction monitoring mass spectrometry. Journal of proteome research, 2015, 14(9): 3658-3669.

[5] Dimayacyac-Esleta B R T, Tsai C F, Kitata R B, et al. Rapid high-pH reverse phase StageTip for sensitive small-scale membrane proteomic profiling. Analytical chemistry, 2015, 87(24): 12016-12023.

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服务简介

蛋白质组学是以一个细胞、组织内表达的全部蛋白质为研究对象,其具有蛋白质种类复杂多样、丰度范围宽泛等特点。为获得深度覆盖蛋白质表达谱,利用分级方法,根据肽段理化性质的不同将其进行分级操作,降低肽段的复杂程度,提高其鉴定能力。

原理

提取样品中的总蛋白,经胰蛋白酶酶解成肽段后,根据肽段理化性质的不同将其进行分级操作,分级后的肽段利用液相色谱-串联质谱联用进行鉴定,然后进行数据库搜索。

应用领域

蛋白质组全谱分析 疾病标志物研究 品种改良 作物抗逆、发育研究 作用机制研究

技术优势

1.操作简便、快速;

2.通量高,不受样本数量限制;

3.样品需求量低,满足微量样品及临床样本的检测;

4.检测动态范围可以达到106数量级。

+ 技术参数

实验路线

deep-proteome-coverage-process

实验仪器

Q-Exactive HF, Orbitrap Fusion

送样要求

样品类型送样要求
组织样品动物组织≥15mg;植物组织≥50mg;微生物组织≥20mg
细胞样品细胞量≥107
蛋白溶液≥1ug/μL,蛋白总量≥60μg
+ 文献及案例

参考文献

[1] Rappsilber J, Mann M, Ishihama Y. Protocol for micro-purification, enrichment, pre-fractionation and storage of peptides for proteomics using StageTips. Nature protocols, 2007, 2(8): 1896-1906.

[2] Kulak N A, Pichler G, Paron I, et al. Minimal, encapsulated proteomic-sample processing applied to copy-number estimation in eukaryotic cells. Nat. Methods, 2014, 11(3): 319-324.

[3] Han D, Moon S, Kim Y, et al. In‐depth proteomic analysis of mouse microglia using a combination of FASP and StageTip‐based, high pH, reversed‐phase fractionation. Proteomics, 2013, 13(20): 2984-2988.

[4] Kitata R B, Dimayacyac-Esleta B R T, Choong W K, et al. Mining missing membrane proteins by high-pH reverse-phase StageTip fractionation and multiple reaction monitoring mass spectrometry. Journal of proteome research, 2015, 14(9): 3658-3669.

[5] Dimayacyac-Esleta B R T, Tsai C F, Kitata R B, et al. Rapid high-pH reverse phase StageTip for sensitive small-scale membrane proteomic profiling. Analytical chemistry, 2015, 87(24): 12016-12023.

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